贾基洛尼亚大学原名为“克拉科夫大学”，1365年由卡西米爾三世建立。中欧各国之间唯有捷克的查理大学建校历史更悠久。 19世纪“克拉科夫大学”改名“贾基洛尼亚大学”，以纪念波兰的亞蓋洛王朝。 许多名人都曾经毕业于贾基洛尼亚大学。